Brennigon, in dem Fall liegt es nicht an den Servereinstellungen. Ich hatte in 0.4 auch zwei mal das Erlebnis, die gesamte Base repariert zu haben und eine halbe Stunde später war wieder alles bei 68%. Die verwendeten Werkzeugkisten waren auch bei mir weg.
Beim zweiten Mal war es sogar so, dass ich die Base mehrmals reparieren musste, bis es denn auch im 'frischen' Zustand abgespeichert wurde. Dazwischen habe ich mich immer nur kurzzeitig mit dem Auto von der Base entfernt. Vergleichbar mit den abgeholzten Bäumen, die dann wieder angezeigt werden, aber nicht wirklich da sind.